由于離子色譜分析結構復雜，精度要求高，特定故障的原因復雜多變。因此，分析人員需要在實踐中糾正他們的態度，嚴格遵循氣相色譜儀的操作說明，熟悉氣相色譜儀組件的功能及其相互關系。一旦氣相色譜儀發生故障，它應該快速響應并逐一消除，盡快解決問題。

 

　　離子色譜分析進樣時間的長短對柱效率影響很大，若進樣時間過長，使色譜區域加寬而降低柱效率，因此、對于沖洗法色譜而言，氣相色譜儀進樣時間越短越好，快進快出，但是一定要穩！一般必須小于1秒鐘。一般執行的是要習慣性的前后針的速度要保持一致，這有利于氣相色譜儀譜圖的重現性好，特別是需要比較時。

 

　　離子色譜分析進行清洗的過程當中，要用專業的清洗工具，不要對氣相色譜儀造成二次污染，還有電路板的維護和清潔特別重要，要先把電源切斷，再對其進行打掃，氣相色譜儀多個電路部位都要仔細清理，注意要戴好手套，防止產生靜電或是水漬和汗漬滴落在電路板上，對氣相色譜儀元件造成影響。玻璃管還有分流管線也要好好清洗，注意對于有堵塞的地方，要著重進行清理，因為在氣相色譜儀長時間使用后，經常會堵塞情況發生。

 

　　雖然氣相色譜儀相對光學儀器在使用場合，安裝位置要求不嚴格，但在操作某些檢測器和高靈敏度工作時還應注意以下條件：

 

　　1、使用場合：溫度，濕度，大氣壓力，震動，電磁干擾，有無腐蝕性氣體，通風，雜光，水源，塵埃等可能對氣相色譜儀工作的影響；

 

　　2、離子色譜分析安裝基座平穩抗震，面積大小，位置，維修是否方便；

 

　　3、氣相色譜儀氣源的供給方法，安裝操作，純度等能否滿足要求。